Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms