Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms