Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms