Protein–RNA interactions for Protein: Q96IL0

APOPT1, Apoptogenic protein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOPT1Q96IL0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOPT1Q96IL0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms