Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms