Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNRF4Q8WWF5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms