Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD1Q8N9F7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms