Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms