Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms