Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms