Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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