Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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