Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms