Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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