Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms