Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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