Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TRAF2Q12933 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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TRAF2Q12933 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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TRAF2Q12933 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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TRAF2Q12933 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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TRAF2Q12933 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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