Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms