Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOS1Q07889 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms