Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms