Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms