Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms