Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HBBP68871 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HBBP68871 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
HBBP68871 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
HBBP68871 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
HBBP68871 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
HBBP68871 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
HBBP68871 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
HBBP68871 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HBBP68871 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms