Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms