Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF7P61962 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms