Protein–RNA interactions for Protein: P57081

WDR4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR4P57081 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR4P57081 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
WDR4P57081 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR4P57081 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR4P57081 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR4P57081 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR4P57081 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR4P57081 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR4P57081 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR4P57081 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR4P57081 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR4P57081 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR4P57081 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR4P57081 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR4P57081 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR4P57081 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR4P57081 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms