Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPAP49450 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPAP49450 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPAP49450 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms