Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms