Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms