Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5F1P24539 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms