Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGCP20142 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGCP20142 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms