Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHGAP10645 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHGAP10645 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHGAP10645 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms