Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA6AP0CW24 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA6AP0CW24 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms