Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms