Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNKO75909 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNKO75909 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNKO75909 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNKO75909 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNKO75909 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNKO75909 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNKO75909 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNKO75909 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNKO75909 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNKO75909 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNKO75909 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNKO75909 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNKO75909 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCNKO75909 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCNKO75909 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNKO75909 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCNKO75909 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCNKO75909 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCNKO75909 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNKO75909 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNKO75909 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CCNKO75909 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNKO75909 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNKO75909 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNKO75909 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNKO75909 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNKO75909 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNKO75909 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNKO75909 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNKO75909 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNKO75909 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNKO75909 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNKO75909 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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