Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALUO43852 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALUO43852 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALUO43852 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms