Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms