Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms