Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms