Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC144AA2RUR9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC144AA2RUR9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms