Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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RABGEF1Q9UJ41 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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RABGEF1Q9UJ41 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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RABGEF1Q9UJ41 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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RABGEF1Q9UJ41 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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RABGEF1Q9UJ41 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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