Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms