Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms