Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms