Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms