Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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