Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms