Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms