Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms