Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms